Pais: Brasil

Fecha: 04 de Mayo del 2021

Herramienta genética analiza cepas de camarón gris  por Embrapa, Brasil

    La herramienta indica criadores más adecuados para evitar el cruzamiento de animales emparentados, que están más sujetos a problemas genéticos.

    Más barato y más rápido que la competencia, VannaPlus ofrece soluciones simples y sólidas a los productores de larvas de camarón.

    VannaPlus tiene el potencial de impulsar la cadena de producción de camarón al agregar datos genéticos a los animales reproductores.

    La tecnología también ayuda y acelera la mejora genética de la especie.

    El desarrollo se basó en la informática de alto rendimiento aplicada a la bioinformática.

VannaPlus, una herramienta genómica desarrollada por investigadores de Embrapa Genetic Resources and Biotechnology (DF) y Embrapa Informática Agropecuária (SP), ayudará a la cadena de producción de camarón gris ( Litopenaeus vannamei ) en los programas de cría y, principalmente, en la identificación del pedigrí de camarones de múltiples familias criados en estanques de engorde. Es un gran desafío, ya que no es posible marcar a cada animal individualmente con los métodos convencionales utilizados en otros sectores de la producción animal.

Ya disponible para aquellos interesados ??en optimizar los cruces para el mantenimiento de líneas genéticas, VannaPlus es otro activo tecnológico que prueba la paternidad, el parentesco y hace la identificación individual del camarón gris. La herramienta fue desarrollada por los investigadores Alexandre Caetano y Patrícia Ianella , con la participación del investigador Michel Yamagishi y el equipo Laboratorio de Bioinformática Multiusuario ( LMB del ) de Embrapa. El laboratorio cuenta con una infraestructura computacional de alto rendimiento que se ha aplicado en análisis bioinformático para el desarrollo de los activos de la Plataforma AquaPlus ( ver tabla a continuación ).

Basado en un panel de marcadores SNP de ( polimorfismos de nucleótido único baja densidad ), VannaPlus permite a los productores de larvas gestionar el plantel de reproducción, reduciendo el riesgo de cruces indeseables para que el criador produzca más y mejor. “Además de brindar soluciones para el manejo genético de los mejoradores y reducir los cruces consanguíneos, la herramienta puede ayudar a los programas de mejoramiento en los procesos de evaluación, selección y mejoramiento y, así, racionalizar la adquisición y venta de germoplasma entre productores”, comenta Ianella. Los cruces entre animales emparentados, llamados endogámicos, dan como resultado crías más sujetas a problemas genéticos como malformaciones e incluso bajo rendimiento zootécnico. El uso de VannaPlus permitirá al productor identificar animales genéticamente distantes y recomendar cruces que tengan más probabilidades de éxito. La tecnología también promoverá la agregación de información y valor para el mercado de cría de camarones (la cría de camarones en cautiverio).

Alexandre Caetano dice que, al igual que las otras especies de interés acuícola, el marcado e identificación individual del camarón presenta enormes desafíos para el manejo genético de los criadores porque las formas jóvenes de estos animales son milimétricas y no pueden marcarse con métodos convencionales. Además, el camarón se somete a un proceso de cambio del exoesqueleto (del caparazón) durante el crecimiento. VannaPlus resuelve esta dificultad con bajo costo y rapidez. El científico informa que actualmente Embrapa tiene capacidad para procesar y analizar dos mil muestras por semana y ese volumen pronto se duplicará.

Plataforma Aqua P lus

Es un conjunto de soluciones simples, prácticas e innovadoras, ya desarrolladas o en desarrollo por Embrapa, para la calificación, manejo y mejoramiento genético de especies acuícolas. Además de los paneles de marcadores SNP ( polimorfismo de nucleótido único ) desarrollados y validados para realizar cada análisis, cada herramienta genómica tiene su propio conjunto de análisis in silico (en la computadora) que son realizados por el equipo involucrado a partir de los datos generados por los analizados. muestras. Actualmente hay cuatro activos (herramientas) disponibles en la plataforma (TambaPlus Pureza, TambaPlus Kinship, VannaPlus y TrutraPlus); tres se encuentran en la etapa final de pruebas para tilapia (TilaPlus), pirarucu (ArapaimaPlus) y pirapitinga (PirapitingaPlus); y otros en desarrollo.

“Además, estamos preparando herramientas genómicas más avanzadas, cuando el sector productivo esté listo para usarlas en los programas de mejoramiento que se espera emerjan en un futuro próximo. Por ejemplo, cuando Embrapa y grandes grupos del sector privado implementen programas de cría de tambaqui, nuestro grupo ya estará preparado para genotipar reproductores con chips de alta densidad, que pueden ser utilizados para la selección genómica, como lo hemos hecho en otras especies para mucho tiempo, más de una década. También se hizo el mismo trabajo con los camarones ”, dice Ianella.

Traducido del portugués.

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