Pais: Países bajos

Fecha: 16 de Marzo del 2021

La nueva plataforma de datos global facilita a los investigadores de todo el mundo la vinculación de datos genéticos y metabólicos por WUR, Países bajos

El metabolismo es el proceso por el cual las células de los seres humanos, así como las plantas, los animales y otros organismos, producen metabolitos como aminoácidos, carbohidratos y hormonas. Estos metabolitos son invaluables. Una nueva plataforma de datos global creada por la Universidad e Investigación de Wageningen hará que sea mucho más fácil para los investigadores de todo el mundo vincular la información genética y de otro tipo sobre los metabolitos, los organismos que los producen y el proceso del metabolismo. Esto allanará el camino para una identificación más rápida de metabolitos actualmente desconocidos que, por ejemplo, poseen capacidades antibióticas o antivirales, o contribuyen a un mayor rendimiento de los cultivos.

La nueva plataforma es una iniciativa del Grupo de Bioinformática de la Universidad e Investigación de Wageningen (WUR) y se puede encontrar en línea a través de https://pairedomicsdata.bioinformatics.nl . Se publicó una publicación sobre la plataforma en el sitio web de la revista líder Nature Chemical Biology .

Plataforma de datos Omics emparejada

El Grupo de Bioinformática de WUR se especializa en el desarrollo de algoritmos y software que se pueden utilizar para desentrañar la estructura y función del ADN y metabolitos de plantas, bacterias y hongos y para buscar características específicas. Sin embargo, en muestras complejas, rastrear las estructuras de los metabolitos y del organismo que los produce sigue siendo un desafío muy difícil. También es difícil saber qué genes son responsables de la producción de ciertos metabolitos. La plataforma de datos ómicos emparejados debería simplificar este proceso y contribuir a una caracterización más rápida de los nuevos metabolitos.

Colaboración global

La plataforma ha sido creada en cooperación con investigadores del Centro de eScience de los Países Bajos y la Universidad de California en San Diego (EE. UU.). Juntos, han creado un consorcio de más de cien científicos de más de diez países diferentes. Todos estos científicos proporcionaron comentarios sobre el contenido de la plataforma y la llenaron con más de 4800 conjuntos de datos genómicos y metabólicos vinculados de varios organismos y comunidades microbianas. La plataforma ya se está utilizando para desarrollar nuevos algoritmos para vincular automáticamente grupos de genes y espectros de metabolitos.

Alimentando a la población mundial

"Teniendo en cuenta que la población mundial crecerá significativamente en las próximas décadas, esperamos descubrir, por ejemplo, qué bacterias producen metabolitos que promueven el crecimiento de las plantas y el rendimiento de los cultivos", dice el líder de la investigación Justin van der Hooft. "Pero también podría trazar un mapa de qué metabolitos tienen un efecto antibiótico o antiviral y en qué organismos se encuentran. Esto no solo es importante desde el punto de vista de la promoción de la salud, sino que también puede resaltar la necesidad de proteger mejor ciertos organismos y la biodiversidad en general."

Traducido del inglés.

Ver nota