Pais: Países bajos

Fecha: 10 de Diciembre del 2019

Buscar antibióticos impulsados por el nuevo software WUR, Países bajos

El descubrimiento de nuevos antibióticos se ha estancado durante años, mientras que la cantidad de bacterias que son resistentes a los antibióticos existentes está en aumento. Con el nuevo software desarrollado por investigadores de Wageningen University & Research (WUR), ahora es posible buscar nuevos antibióticos mucho más rápidamente: en lugar de mapear un solo genoma de un organismo productor de antibióticos a la vez, miles de genomas finalmente pueden ser analizado y mapeado a la vez para identificar vías hacia la producción de compuestos medicinales potencialmente novedosos. El software fue presentado la semana pasada en una publicación en la reconocida revista científica Nature Chemical Biology. Descubrimiento de nuevas moléculas microbianas. La mayoría de los antibióticos se basan en moléculas hechas por bacterias y hongos. Utilizan estas moléculas para protegerse contra sus enemigos naturales. Los investigadores luego usarán estas moléculas como nuevos antibióticos. Aunque se han descubierto decenas de miles de microbios en las últimas décadas, estos solo constituyen una pequeña fracción de las moléculas potenciales aún por descubrir. Un conocimiento más profundo de la diversidad de las estructuras químicas de estos llamados metabolitos microbianos es esencial para el desarrollo de antibióticos y medicamentos contra el cáncer, pero también para los complementos alimenticios, por ejemplo. El nuevo software acerca este conocimiento un paso más. Con nuestros programas de software, puede analizar automáticamente datos de grandes cantidades de genomas. Este es un gran avance para la investigación de antibióticos. Marnix Medema. Profesor Asistente de Bioinformática "Nuestro software BiG-SCAPE y CORASON (este último fue desarrollado por / con colegas mexicanos) le quita mucho trabajo a los investigadores", dice el profesor asistente de bioinformática Marnix Medema. "El hecho es que se han secuenciado tantos cientos de miles de genomas bacterianos (su código de ADN determinado) que se ha vuelto muy difícil para los científicos mapear la diversidad metabólica inexplorada y saber cuáles necesitan más investigación en el laboratorio". Minería del genoma El software ayuda con la extracción del genoma, una tecnología clave que ha surgido en la última década como una nueva forma de descubrir y utilizar la diversidad de moléculas microbianas. Sin embargo, hasta hace poco, esto solo podía usarse en genomas individuales, lo que consumía mucho tiempo y obstaculizaba la rápida expansión de la cantidad de antibióticos disponibles, por ejemplo. Medema: "Con nuestros programas de software, puede analizar automáticamente datos de grandes cantidades de genomas. Esto le permite mapear muy rápidamente la diversidad de vías biosintéticas en miles de genomas simultáneamente mediante el uso de análisis de red para agruparlos en familias y desentrañar sus relaciones evolutivas. Este es un gran avance para la investigación de antibióticos ". Productos más naturales Este avance abre un gran potencial para descubrir nuevas sustancias medicinales, ya que el software permite identificar y probar una enorme diversidad de moléculas naturales en la búsqueda de los mejores antibióticos, por ejemplo. En colaboración con investigadores estadounidenses, los científicos de WUR han utilizado con éxito esta técnica para mapear sistemáticamente una amplia gama de vías biosintéticas a los 'antibióticos' (moléculas que protegen a las bacterias de los antibióticos). Traducido del inglés. Ver nota