Pais: Brasil

Fecha: 22 de Marzo del 2017

Los científicos han secuenciado el genoma de pescado brasileño, EMBRAPA

La piscicultura brasileña está a punto de hacer una herramienta importante para su gestión y cría. Una búsqueda a nivel nacional está secuenciando el genoma de los dos peces más autóctonos producidos en el país: cachama ( Colossoma macropomum ) y cachara Amazon ( Pseudoplatistoma punctifer ), también conocido como el pez gato. El trabajo se lleva a cabo bajo la Red de Genómica Animal coordinado por Embrapa y reúne a instituciones de investigación de todo el Brasil. El genoma es el conjunto de información genética codificada en el ADN de un organismo, entre los cuales están los genes que influyen en rasgos de interés productivo, tales como calidad de la carne y el aumento de peso, por ejemplo. Además de la relevancia de la cadena de producción, la secuenciación del genoma de cachama y cachara es muy importante para la investigación científica en varias áreas, ya que estas especies son representativos de dos órdenes diferentes: el Characiformes, que los grupos con aletas de pescado, incluyendo cachama, y los Siluriformes, que incluye el pez gato, peces de cuero grupo incluyendo cachara y pintado. El alcance de los resultados permitirá que los genomas secuenciados sirvan como referencia para los estudios de otras especies similares que pertenecen a dos órdenes. Para los agricultores de pescado, el conocimiento del genoma podría proporcionar avances importantes en la gestión genética de las dos especies matrices de animales de cría. Debido a la falta de buenas herramientas y procesos adecuados para jugadores de control de pedigrí, los productores de alevines a menudo pueden realizar apareamientos entre peces estrechamente relacionados, y por lo tanto generar animales con deformidades y bajo rendimiento productivo, y otros problemas genéticos. "La información que se extrae por el equipo se utilizará inicialmente para generar herramientas moleculares para mejorar el manejo genético de los rebaños de cría de propiedades que trabajan con estas especies", explica Alexandre Rodrigues Caetano, investigador de Embrapa Recursos Genéticos y Biotecnología Ingeniero de red y genómica animal. Con un futuro análisis genético subvencionado por el secuenciado los genomas, se puede detectar la relación parental entre los animales y recomendar al productor las mejores parejas a formar, favoreciendo la distancia genética entre las oficinas centrales y las características de los animales que son almejadas. "Con la información que se genera, además de la organización de los cruces, la cría de peces puede en el futuro cercano utilizando métodos avanzados tales como la selección genómica, para generar cepas más productivas adaptadas a los sistemas de producción en cautividad", dice Caetano. Otro enfoque del trabajo que ejecuta el equipo es el desarrollo de herramientas robustas para la identificación híbrido. condiciones de cautiverio, es común que cruza diferentes especies que generan los llamados híbridos interespecíficos. Esta práctica es especialmente entre surubins: cacharas se pueden cruzar con pintadas, o jundiás-la-amazónica; y entre los peces redondos: cruces entre tambaquis y pargos o cachama y pacú. Los resultados de estas uniones, y pintacharas tambacus, por ejemplo, han sido ampliamente utilizados para el engorde y masacre en el sector productivo, y excepcionalmente pueden ser utilizados como matrices para algunos productores, ya que son fértiles. Con cada generación, se hace más difícil saber si el animal es puro o híbrido y lo que sería la medida de la mezcla y sus posibles consecuencias, causando gran dificultad para controlar el perfil genético de las matrices. Los datos generados por la secuenciación del genoma de referencia fueron extraídos para identificar cientos de marcadores moleculares útiles para identificar peces híbridos. Los cálculos estadísticos muestran que los marcadores prospectados pueden detectar el grado de hibridación de cada animal, incluso después de varias generaciones de cruces con una especie de absorción de interés. Con las herramientas generadas que se encuentran en la fase de validación, que será fácil de identificar cruces antiguas que alteraron la pureza de pescado. El uso de herramientas genómicas ha acelerado la reproducción de la especie. Los métodos tradicionalmente utilizados para identificar mejores animales rendimiento para su uso como reproducción depende de la medición de las características de interés de los propios animales, cuando sea posible, así como sus descendientes, que es por lo general mucho tiempo y tiene altos costos. En el proceso llamado datos de selección genómicas de decenas de miles de marcadores genéticos pueden ser utilizados para determinar el valor genético de un individuo, de modo que una muestra de su ADN puede ser recogido. "Estamos desarrollando una amplia obra, imprescindible para generar herramientas con las perspectivas de aplicación en el corto, mediano y largo plazo", explica Alexandre Caetano. No es coincidencia que los peces de gran importancia económica en todo el mundo han tenido sus genomas secuenciados. Este es el caso del pez cebra ornamental ( Danio rerio ), el salmón ( Salmo salar ) y la tilapia ( Oreochromis niloticus ), la especie más comúnmente producidos por la agricultura nacional de pescado. Herramientas y métodos para la aplicación de la selección genómica en el salmón de cultivo ya están siendo ampliamente utilizados en los programas de mejoramiento de los principales países productores. Originarios de África, la tilapia es la especie más cultivada en Brasil y mueve un nivel tecnológico de la cadena de producción y desarrollado que muestra un desempeño de crecimiento no ha igualado por especies brasileñas. Para los investigadores, el aumento tecnológico de la cadena productiva de los peces nativos a los niveles alcanzados en el cultivo de tilapia dependen necesariamente el uso de herramientas genómicas para resolver los problemas básicos de la gestión genética de la cría y desarrollo de mejoras.